小儿泌尿外科是东莞市儿童医院重点学科之一，是以临床医疗为主，兼顾教学、科研工作的重要科室。现有专科医师团队7人，其中教授兼硕士研究生导师2人，中高级职称7人，专科护理团队11人。

科室拥有小儿高清腹腔镜手术系统、小儿泌尿内镜系统、Laborie尿动力仪、尿流率测定仪、尿道下裂专用精细手术器械及手术双目放大镜、钬激光治疗仪、超声刀等专科设备。

诊治范围主要包括小儿泌尿生殖系统各种先天性畸形、肿瘤、结石、感染、外伤等疾病，着重发展微创小儿泌尿外科、腔道小儿泌尿外科、尿道下裂精准手术矫治等特色技术。同时科室还开展了尿动力学检查研究、生物反馈、包皮门诊等具有专科特色诊疗项目，及联合多学科(MDT)成立排尿功能障碍诊疗中心、性别发育障碍（DSD）诊疗中心等。