检查前一个月避免服用抗生素，以免抑制肠道正常菌群而影响检查结果；
检查前一周内未做灌肠术；
检查前一天应避免食用富含粗纤维或不易消化的食物，如玉米、糙米、大麦、大豆、其他杂粮、面粉、食物、奶制品、蔬菜、水果等。检查前通常需禁食12小时，但可适当饮水，检查前应认真清洁口腔，检查前4小时停用促胃肠动力药，检查前2小时避免吸烟或剧烈运动。
胃肠道梗阻、消化道大出血、急性胰腺炎及其他严重应激状态下不能进食者不能做氢呼气试验。

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