心胸外科自1989年进行了第一例低温体外循环心内直视手术以来，历经20多年的发展与积累，在红河州地区率先开展了多项心胸外科高难度手术和技术攻关。为更好地服务红河州人民群众，顺应学科专业化发展的趋势，2017年7月1日医院心胸专业组正式从心胸神经外科独立，成立专业从事先天性心脏病、联合瓣膜病、复杂大血管疾病、肺、食管、纵隔、胸壁疾病外科治疗及胸部外伤救治的心胸外科。目前是云南省心脏大血管外科专科联盟协作单位，专业学科的设立为患者提供了更专业、更优质的服务。
心胸外科现有编制床位32张，拥有州内高水平的专科重症监护室（ICU），监护室床位7张，有创呼吸机4台。科室人员结构合理，其中硕士生导师、主任医师1人，副主任医师2人，主治医师及住院医师等多人，护理队伍12余人，包括主管护师及护师多名。心胸外科秉承红医精神，拼搏奋进，不断发展，取得优异的成绩：荣获多项州级以上科技成果奖，在中华系列及核心期刊专业期刊发表十余数篇论文。
科室特色医疗：心脏外科技术在同等地区级医院处于领先水平，常规开展房间隔缺损、室间隔缺损、先天性动脉导管未闭、法乐氏四联症等先天性心脏病、人工机械瓣膜及生物瓣膜置换、瓣环成形，心包剥脱及心脏创伤的紧急抢救。
胸腔镜手术有着创伤小，术后病人疼痛轻，恢复快，住院时间短等优点。心胸外科常规开展胸腔镜微创技术，有着雄厚的技术实力和丰富的临床经验，目前已能运用于绝大部分的普胸外科疾病，如：全胸腔镜下肺叶、肺段切除、肺毛玻璃样肺结节的诊断与治疗、肺大泡切除、手汗症、漏斗胸矫治及纵隔纵瘤切除、I-II期慢性脓胸的胸腔镜微创治疗等。
3、肺癌的规范化治疗，尤其是肺癌的早期诊断及外科治疗
心胸外科在参照肺癌临床诊疗指南、吸取国内外先进理论和总结自身多年经验的基础上，为每一位肺癌患者制定个体化、规范化的治疗方案，完善的术前检查、规范化的手术治疗及术后长期的随访指导；目前大多数早、中期肺癌患者均在胸腔镜下实施微创根治性手术，手术创伤小，痛苦轻，术后恢复快，疗效佳；同时科室可独立完成气管肿瘤，支气管、肺动脉袖式肺叶切除等普胸外科的高难度手术。
食管癌是胸外科常见的恶性肿瘤之一，规范化的食管癌治疗是心胸外科医疗特色，术前系统的机体调理，营养状况的改善；术中肿瘤的完整切除、淋巴结的彻底清扫；术后并发症的预防和顺利康复等方面积累了一套完整的临床经验，手术疗效好，并发症少，复发率低。2017年5月心胸外科在州内成功开展第一例全胸、腹腔镜下食管癌微创根治手术。
纵膈肿瘤常规行胸腔镜微创切除手术。合并重症肌无力的胸腺瘤的外科治疗采取同期双侧胸腔镜微创手术，创伤小，肌无力危象发生率低，疗效良好，彻底改变了传统正中劈开胸骨手术的巨大创伤及严重影响美观的手术瘢痕。
漏斗胸、鸡胸等先天性胸廓畸形，通过胸腔镜辅助下NUSS手术的微创外科治疗是心胸外科特色之一，手术创伤小，疗效满意，术后疼痛轻、并发症少，住院周期短，费用低。目前已在红河州率先开展及应用成熟。
医院为州内急危重症外伤患者的急救中心所在地，针对胸部外伤的急危重症及全身多处复合伤的患者，具有丰富的临床诊治经验及强大的重症监护管理团队，目前开展创伤不稳定胸壁的内固定治疗，胸腔镜下凝固性血胸清除、肺裂伤修补、心脏火器伤及心脏刀伤等抢救及治疗。
经过几十年的发展，医院心胸外科专业团队历经艰难、百折不挠，用扎实的理论基础及丰富的临床经验作为学科的技术积淀，开拓创新、不断更新专业知识，紧跟国内、国际动态；学科带头人担任省级相关学术专业委员会副主任委员，团队多名成员担任国内、省内胸心血管外科相关专业常委、委员。荣获州级以上科技成果奖3项，在北大核心期刊发表1篇，中华系列及科技核心期刊专业期刊发表10余篇论文。
