肠镜能查小肠。大肠镜就是电子结肠镜，可以查到小肠的末端，回肠大概20cm的距离。查小肠可以通过小肠镜或者胶囊内镜。
小肠镜可以经过肛门或者口腔进镜；或者上半部分经口，下半部分经肛对接的方式进镜，完成完整的小肠镜的检查。这两种检查在诊断的图像水平上没有差异，区别是通过小肠镜可以进行活检，在小肠镜下可以进行治疗；胶囊内镜只能进行观察，用作诊断，不能取活检、做治疗。

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