检查的并发症：
1，检查部位的并发症：检查时的穿刺部位可能会出现疼痛或感染淤血或出血等现象，大部分过几天就自然好转。
2，对孕妇和胎儿的并发症：部分产妇会出现注射针引起的感染或出血现象，子宫收缩引起的早期阵痛或胎膜早破，因此也有发生流产的可能性，但很罕见。
3，检查失败：双胞胎时两个胎儿中可能只显示其中一个的结果，由于胎盘部位异常等原因，已有不适宜进行羊水采取的情况。为了实施染色体检查，要培养羊水中的胎儿细胞，部分产妇羊水的细胞培养不佳，可能会发生重新实施羊水穿刺的情况。
4，此外，胎儿也有被刺伤的可能，但一般会自行愈合；还有少部分接受过羊水穿刺的胎儿，在出生之后会比较容易出现呼吸窘迫的问题，而发生率一般约为1.1%左右，是未接受过穿刺胎儿的两倍以上。

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