肠镜检查虽然相对而言较为安全，但仍有部分患者可能会出现以下并发症。
1、药物过敏反应
部分患者可能会因检查前应用的相关药物而出现头晕，皮疹、哮喘等过敏反应。
2、局部并发症
活组织检查或息肉切除部位可能会发生出血、肠穿孔等并发症，严重者可能需要住院或手术治疗。检查后如出现呕血、便血、严重腹痛、低血压等症状，应及时急诊就医。
3、全身并发症
部分高龄或存在危险因素，患者检查后可能出现心律失常、心肌梗死、低氧血症、肺炎、脑卒中等并发症，极少数患者甚至可能会因病情恶化而导致死亡。
4、检查失败
检查前如肠道准备不充分、有粪便残留或因严重肠粘连造成内镜进入不畅等，都可能会导致检查失败。部分患者即使已给予适量镇静剂，也有可能会因镇静效果不佳或配合度过低等而导致检查无法正常进行。
此外，如检查中患者出现呼吸困难、低氧血症、低血压等症状，为确保安全也有可能会考虑中止检查。

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