临床上，预防脑血栓的药物常用的有他汀类调脂药物、抗凝药物、抗血小板聚集药物、中成药等。服用药物需要严格遵守医生医嘱，定时定量服用，不可盲目自行用药。
他汀类调脂药物可以使低密度脂蛋白含量降低，降低血栓形成条件，可以选用的药物如阿托伐他汀、瑞舒伐他汀等。抗凝药物如低分子量肝素、华法林等，可以通过提高体内的凝血因子活性化，从而达到抗凝作用，预防血栓形成。而抗血小板聚集药物，如阿司匹林、氯吡格雷等可通过减少血小板间的黏附，从而降低脑血栓形成的风险。
中成药像同仁堂消栓通络片，能够活血化瘀、温经通络，改善血液微循环，降低血液黏度，抑制血小板聚集，从而有效的预防血栓的形成。

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